Berikut adalah ringkasan pembahasan dari video “quetion and answer sintesa protein” oleh Bu Andri yang menjawab lima pertanyaan utama siswa seputar mekanisme sintesis protein:

1. Arah Pemanjangan dan Pembacaan Kodon (5′ ke 3′)
   • Pembacaan serta pemanjangan rantai mRNA dalam sintesis protein wajib berlangsung dari arah 5′ ke 3′.
   • Hal ini disebabkan oleh struktur kimia nukleotida: gugus fosfat terikat pada atom C nomor 5 dari gula ribosa, dan setiap nukleotida baru yang bergabung harus berikatan pada atom C nomor 3 dari gula ribosa nukleotida di depannya.
2. Penentuan Rantai Template DNA
   • Rantai template (cetakan) tidak selalu berarah 3′ ke 5′.
   • Karena struktur DNA berbentuk tiga dimensi, penentuan rantai mana yang menjadi cetakan sangat bergantung pada letak TATA box, titik inisiasi, dan arah pergerakan RNA polimerase. Jika RNA polimerase bergerak ke kanan, rantai bawah menjadi cetakan; jika bergerak ke kiri, rantai atas yang menjadi cetakan.
3. Mekanisme Splicing pada mRNA
   • Splicing adalah proses pembuangan intron (urutan mRNA yang tidak dapat diterjemahkan menjadi protein) dan penggabungan kembali segmen-segmen ekson (urutan yang dapat diterjemahkan).
   • Proses ini terjadi pada sel eukariotik sebelum transkripsi dilanjutkan ke translasi, dan diakhiri dengan penambahan penanda berupa 5′ cap serta poly-A tail pada rantai mRNA.
4. Perbedaan antara Primer dan Promotor
   • Primer merupakan sepotong RNA pendek yang berfungsi memulai replikasi DNA.
   • Promotor adalah daerah khusus pada DNA (ditandai dengan urutan TATA box) yang bertindak sebagai petunjuk bagi RNA polimerase untuk menemukan titik inisiasi transkripsi (sekitar 25 nukleotida dari lokasi promotor).
5. Peran Signal Sequence
   • Signal sequence adalah urutan asam amino di bagian awal rantai protein yang berfungsi sebagai kode penunjuk tujuan akhir atau alamat pengiriman protein (misalnya menuju kloroplas, mitokondria, retikulum endoplasma, atau disekresikan keluar sel).